Pelabuhan Manado merupakan pintu keluar masuk perkapalan dari dan ke Manado.
Kapal-kapal tersebut melayani rute ke Kabupaten Sitaro, Sangihe, Talaud, Maluku dan Maluku Utara.
Dari sini juga diberangkatkan kapal kapal yang melayani pulau Bunaken, Manado Tua dan Siladen.
Di sekitar pelabuhan Manado tersedia berbagai toko, hotel dan penginapan.